Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRDNQ13061 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRDNQ13061 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRDNQ13061 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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