Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
STRN3Q13033 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRN3Q13033 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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