Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC10A2Q12908 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC10A2Q12908 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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