Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BPTFQ12830 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BPTFQ12830 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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