Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SREBF2Q12772 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SREBF2Q12772 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
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