Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNDQ07001 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms