Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TYRO3Q06418 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TYRO3Q06418 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms