Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX2Q02962 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX2Q02962 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms