Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP1P78357 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms