Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HERVK_113P63132 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms