Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
ROMO1P60602 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms