Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP1P56182 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP1P56182 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP1P56182 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP1P56182 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP1P56182 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP1P56182 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP1P56182 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP1P56182 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP1P56182 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP1P56182 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP1P56182 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP1P56182 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP1P56182 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP1P56182 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP1P56182 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP1P56182 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP1P56182 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP1P56182 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP1P56182 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP1P56182 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP1P56182 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP1P56182 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP1P56182 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP1P56182 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP1P56182 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP1P56182 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP1P56182 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP1P56182 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP1P56182 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP1P56182 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP1P56182 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP1P56182 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP1P56182 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP1P56182 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP1P56182 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP1P56182 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP1P56182 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP1P56182 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP1P56182 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP1P56182 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP1P56182 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP1P56182 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP1P56182 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP1P56182 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP1P56182 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP1P56182 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP1P56182 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP1P56182 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP1P56182 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP1P56182 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP1P56182 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP1P56182 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP1P56182 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP1P56182 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP1P56182 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP1P56182 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP1P56182 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP1P56182 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP1P56182 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP1P56182 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP1P56182 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP1P56182 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP1P56182 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RRP1P56182 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP1P56182 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP1P56182 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP1P56182 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP1P56182 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP1P56182 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP1P56182 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP1P56182 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP1P56182 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP1P56182 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP1P56182 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP1P56182 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP1P56182 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP1P56182 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP1P56182 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP1P56182 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms