Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELLP55199 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELLP55199 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELLP55199 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ELLP55199 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELLP55199 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms