Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLTPP55058 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLTPP55058 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLTPP55058 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLTPP55058 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLTPP55058 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLTPP55058 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PLTPP55058 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PLTPP55058 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLTPP55058 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLTPP55058 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLTPP55058 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLTPP55058 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLTPP55058 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLTPP55058 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PLTPP55058 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLTPP55058 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLTPP55058 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLTPP55058 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLTPP55058 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLTPP55058 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLTPP55058 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLTPP55058 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLTPP55058 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLTPP55058 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PLTPP55058 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLTPP55058 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLTPP55058 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLTPP55058 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLTPP55058 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLTPP55058 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLTPP55058 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLTPP55058 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLTPP55058 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLTPP55058 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLTPP55058 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLTPP55058 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLTPP55058 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLTPP55058 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLTPP55058 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLTPP55058 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLTPP55058 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PLTPP55058 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PLTPP55058 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLTPP55058 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLTPP55058 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLTPP55058 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLTPP55058 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLTPP55058 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLTPP55058 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLTPP55058 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLTPP55058 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLTPP55058 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLTPP55058 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLTPP55058 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLTPP55058 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLTPP55058 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLTPP55058 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLTPP55058 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLTPP55058 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLTPP55058 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLTPP55058 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLTPP55058 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PLTPP55058 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLTPP55058 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLTPP55058 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLTPP55058 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms