Protein–RNA interactions for Protein: P55000

SLURP1, Secreted Ly-6/uPAR-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLURP1P55000 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLURP1P55000 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLURP1P55000 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms