Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHB4P54760 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms