Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP4P49662 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP4P49662 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP4P49662 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP4P49662 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP4P49662 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP4P49662 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP4P49662 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP4P49662 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP4P49662 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP4P49662 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP4P49662 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP4P49662 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP4P49662 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP4P49662 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP4P49662 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP4P49662 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP4P49662 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP4P49662 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP4P49662 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP4P49662 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP4P49662 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP4P49662 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP4P49662 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP4P49662 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP4P49662 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP4P49662 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP4P49662 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP4P49662 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP4P49662 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP4P49662 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP4P49662 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP4P49662 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP4P49662 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP4P49662 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP4P49662 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP4P49662 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP4P49662 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP4P49662 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP4P49662 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP4P49662 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP4P49662 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP4P49662 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP4P49662 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP4P49662 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP4P49662 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP4P49662 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP4P49662 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP4P49662 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP4P49662 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP4P49662 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP4P49662 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP4P49662 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP4P49662 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP4P49662 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP4P49662 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP4P49662 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP4P49662 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP4P49662 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP4P49662 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP4P49662 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP4P49662 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP4P49662 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP4P49662 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP4P49662 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP4P49662 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP4P49662 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP4P49662 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP4P49662 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP4P49662 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP4P49662 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP4P49662 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms