Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CRATP43155 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CRATP43155 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRATP43155 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRATP43155 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRATP43155 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRATP43155 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRATP43155 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRATP43155 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRATP43155 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRATP43155 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRATP43155 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CRATP43155 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRATP43155 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRATP43155 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRATP43155 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRATP43155 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRATP43155 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRATP43155 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRATP43155 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRATP43155 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CRATP43155 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CRATP43155 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CRATP43155 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CRATP43155 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CRATP43155 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CRATP43155 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CRATP43155 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CRATP43155 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CRATP43155 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CRATP43155 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CRATP43155 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CRATP43155 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CRATP43155 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CRATP43155 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CRATP43155 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CRATP43155 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CRATP43155 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CRATP43155 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CRATP43155 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CRATP43155 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CRATP43155 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CRATP43155 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CRATP43155 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CRATP43155 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CRATP43155 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CRATP43155 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CRATP43155 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CRATP43155 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CRATP43155 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CRATP43155 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CRATP43155 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CRATP43155 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CRATP43155 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CRATP43155 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CRATP43155 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CRATP43155 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CRATP43155 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CRATP43155 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRATP43155 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CRATP43155 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CRATP43155 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CRATP43155 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CRATP43155 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CRATP43155 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CRATP43155 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CRATP43155 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CRATP43155 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CRATP43155 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CRATP43155 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CRATP43155 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CRATP43155 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CRATP43155 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CRATP43155 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CRATP43155 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CRATP43155 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CRATP43155 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CRATP43155 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CRATP43155 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CRATP43155 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms