Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PIK3CBP42338 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PIK3CBP42338 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms