Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP62P37198 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP62P37198 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP62P37198 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP62P37198 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP62P37198 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NUP62P37198 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NUP62P37198 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP62P37198 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP62P37198 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms