Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH11P35749 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH11P35749 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH11P35749 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH11P35749 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH11P35749 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH11P35749 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH11P35749 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH11P35749 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYH11P35749 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYH11P35749 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYH11P35749 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYH11P35749 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYH11P35749 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYH11P35749 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYH11P35749 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MYH11P35749 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYH11P35749 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MYH11P35749 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH11P35749 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH11P35749 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH11P35749 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH11P35749 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH11P35749 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH11P35749 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH11P35749 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH11P35749 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH11P35749 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH11P35749 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH11P35749 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYH11P35749 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH11P35749 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH11P35749 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH11P35749 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH11P35749 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH11P35749 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH11P35749 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH11P35749 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH11P35749 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYH11P35749 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH11P35749 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH11P35749 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH11P35749 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH11P35749 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH11P35749 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH11P35749 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH11P35749 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH11P35749 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH11P35749 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH11P35749 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH11P35749 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH11P35749 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH11P35749 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH11P35749 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH11P35749 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH11P35749 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH11P35749 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH11P35749 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYH11P35749 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH11P35749 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH11P35749 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH11P35749 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH11P35749 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH11P35749 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH11P35749 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH11P35749 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH11P35749 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH11P35749 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH11P35749 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH11P35749 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH11P35749 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH11P35749 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH11P35749 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH11P35749 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH11P35749 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYH11P35749 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH11P35749 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH11P35749 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH11P35749 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH11P35749 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH11P35749 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH11P35749 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH11P35749 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH11P35749 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH11P35749 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH11P35749 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH11P35749 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH11P35749 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH11P35749 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH11P35749 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH11P35749 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH11P35749 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH11P35749 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH11P35749 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH11P35749 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYH11P35749 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH11P35749 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH11P35749 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH11P35749 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYH11P35749 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms