Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2H1P32780 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms