Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OTX2P32243 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX2P32243 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX2P32243 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX2P32243 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX2P32243 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX2P32243 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX2P32243 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX2P32243 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX2P32243 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX2P32243 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX2P32243 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX2P32243 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX2P32243 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX2P32243 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX2P32243 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX2P32243 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OTX2P32243 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OTX2P32243 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OTX2P32243 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX2P32243 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX2P32243 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX2P32243 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX2P32243 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX2P32243 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX2P32243 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX2P32243 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX2P32243 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX2P32243 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX2P32243 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX2P32243 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX2P32243 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX2P32243 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OTX2P32243 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
OTX2P32243 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
OTX2P32243 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX2P32243 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX2P32243 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX2P32243 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX2P32243 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX2P32243 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX2P32243 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX2P32243 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX2P32243 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX2P32243 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX2P32243 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX2P32243 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX2P32243 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX2P32243 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX2P32243 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OTX2P32243 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
OTX2P32243 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms