Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA5P20719 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms