Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRHP20396 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRHP20396 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRHP20396 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRHP20396 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRHP20396 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRHP20396 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRHP20396 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRHP20396 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRHP20396 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRHP20396 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRHP20396 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRHP20396 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRHP20396 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRHP20396 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRHP20396 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRHP20396 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TRHP20396 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TRHP20396 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
TRHP20396 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TRHP20396 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TRHP20396 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TRHP20396 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRHP20396 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRHP20396 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRHP20396 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRHP20396 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRHP20396 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
TRHP20396 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRHP20396 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRHP20396 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRHP20396 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRHP20396 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRHP20396 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRHP20396 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRHP20396 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
TRHP20396 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRHP20396 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRHP20396 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRHP20396 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRHP20396 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRHP20396 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRHP20396 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRHP20396 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRHP20396 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRHP20396 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRHP20396 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRHP20396 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRHP20396 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRHP20396 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRHP20396 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRHP20396 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRHP20396 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRHP20396 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRHP20396 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRHP20396 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRHP20396 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRHP20396 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRHP20396 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
TRHP20396 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRHP20396 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRHP20396 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRHP20396 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRHP20396 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
TRHP20396 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
TRHP20396 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
TRHP20396 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRHP20396 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRHP20396 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRHP20396 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRHP20396 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
TRHP20396 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRHP20396 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRHP20396 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRHP20396 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRHP20396 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRHP20396 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRHP20396 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRHP20396 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRHP20396 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRHP20396 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRHP20396 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRHP20396 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRHP20396 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRHP20396 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRHP20396 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRHP20396 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRHP20396 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRHP20396 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRHP20396 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRHP20396 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRHP20396 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRHP20396 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRHP20396 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRHP20396 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRHP20396 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRHP20396 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
TRHP20396 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRHP20396 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRHP20396 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms