Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM21P19474 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms