Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD53P19397 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD53P19397 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD53P19397 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD53P19397 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD53P19397 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD53P19397 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD53P19397 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD53P19397 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD53P19397 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CD53P19397 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD53P19397 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD53P19397 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD53P19397 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD53P19397 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD53P19397 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD53P19397 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD53P19397 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD53P19397 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD53P19397 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD53P19397 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD53P19397 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD53P19397 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD53P19397 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD53P19397 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD53P19397 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD53P19397 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD53P19397 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD53P19397 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD53P19397 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD53P19397 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD53P19397 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD53P19397 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD53P19397 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD53P19397 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CD53P19397 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CD53P19397 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CD53P19397 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CD53P19397 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD53P19397 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD53P19397 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD53P19397 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD53P19397 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD53P19397 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD53P19397 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD53P19397 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD53P19397 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD53P19397 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD53P19397 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD53P19397 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD53P19397 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD53P19397 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD53P19397 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD53P19397 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD53P19397 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CD53P19397 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CD53P19397 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD53P19397 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CD53P19397 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms