Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF4P18085 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF4P18085 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF4P18085 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF4P18085 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF4P18085 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF4P18085 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF4P18085 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF4P18085 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF4P18085 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF4P18085 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF4P18085 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF4P18085 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF4P18085 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF4P18085 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF4P18085 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF4P18085 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF4P18085 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF4P18085 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF4P18085 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF4P18085 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF4P18085 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF4P18085 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF4P18085 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF4P18085 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF4P18085 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF4P18085 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF4P18085 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF4P18085 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARF4P18085 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF4P18085 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF4P18085 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF4P18085 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF4P18085 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF4P18085 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF4P18085 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF4P18085 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF4P18085 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF4P18085 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF4P18085 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF4P18085 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF4P18085 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF4P18085 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF4P18085 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF4P18085 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF4P18085 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARF4P18085 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ARF4P18085 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF4P18085 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF4P18085 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF4P18085 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF4P18085 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF4P18085 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF4P18085 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF4P18085 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF4P18085 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF4P18085 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF4P18085 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF4P18085 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF4P18085 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARF4P18085 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARF4P18085 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF4P18085 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF4P18085 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF4P18085 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF4P18085 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF4P18085 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF4P18085 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF4P18085 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF4P18085 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF4P18085 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF4P18085 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF4P18085 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF4P18085 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF4P18085 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF4P18085 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF4P18085 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARF4P18085 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms