Protein–RNA interactions for Protein: P18077

RPL35A, 60S ribosomal protein L35a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35AP18077 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL35AP18077 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35AP18077 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35AP18077 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35AP18077 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35AP18077 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35AP18077 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35AP18077 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35AP18077 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35AP18077 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35AP18077 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35AP18077 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35AP18077 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35AP18077 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL35AP18077 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms