Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DEFA4P12838 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms