Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GNAT1P11488 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNAT1P11488 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms