Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRFP10586 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRFP10586 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms