Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA6AP0CW24 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms