Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYCNP04198 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYCNP04198 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYCNP04198 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MYCNP04198 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYCNP04198 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYCNP04198 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYCNP04198 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYCNP04198 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYCNP04198 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYCNP04198 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYCNP04198 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYCNP04198 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYCNP04198 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYCNP04198 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MYCNP04198 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MYCNP04198 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYCNP04198 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYCNP04198 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MYCNP04198 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYCNP04198 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYCNP04198 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYCNP04198 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYCNP04198 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYCNP04198 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYCNP04198 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYCNP04198 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MYCNP04198 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MYCNP04198 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MYCNP04198 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYCNP04198 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYCNP04198 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYCNP04198 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYCNP04198 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYCNP04198 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYCNP04198 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYCNP04198 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYCNP04198 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYCNP04198 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYCNP04198 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYCNP04198 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYCNP04198 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MYCNP04198 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms