Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ALDH1A2O94788 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ALDH1A2O94788 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ALDH1A2O94788 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ALDH1A2O94788 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALDH1A2O94788 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms