Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
N4BP1O75113 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
N4BP1O75113 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
N4BP1O75113 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
N4BP1O75113 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
N4BP1O75113 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
N4BP1O75113 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
N4BP1O75113 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
N4BP1O75113 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
N4BP1O75113 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
N4BP1O75113 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
N4BP1O75113 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
N4BP1O75113 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
N4BP1O75113 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
N4BP1O75113 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
N4BP1O75113 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
N4BP1O75113 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
N4BP1O75113 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms