Protein–RNA interactions for Protein: O15213

WDR46, WD repeat-containing protein 46, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR46O15213 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR46O15213 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR46O15213 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR46O15213 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR46O15213 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WDR46O15213 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR46O15213 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR46O15213 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR46O15213 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR46O15213 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR46O15213 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR46O15213 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR46O15213 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR46O15213 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR46O15213 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR46O15213 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR46O15213 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR46O15213 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR46O15213 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR46O15213 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR46O15213 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR46O15213 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR46O15213 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR46O15213 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WDR46O15213 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR46O15213 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR46O15213 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR46O15213 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR46O15213 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR46O15213 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR46O15213 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR46O15213 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR46O15213 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WDR46O15213 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR46O15213 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR46O15213 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR46O15213 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR46O15213 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR46O15213 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR46O15213 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR46O15213 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR46O15213 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR46O15213 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR46O15213 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR46O15213 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR46O15213 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR46O15213 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR46O15213 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR46O15213 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR46O15213 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR46O15213 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR46O15213 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR46O15213 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
WDR46O15213 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR46O15213 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR46O15213 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR46O15213 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR46O15213 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR46O15213 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR46O15213 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR46O15213 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR46O15213 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR46O15213 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR46O15213 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR46O15213 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR46O15213 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR46O15213 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR46O15213 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
WDR46O15213 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
WDR46O15213 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
WDR46O15213 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
WDR46O15213 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
WDR46O15213 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
WDR46O15213 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
WDR46O15213 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
WDR46O15213 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
WDR46O15213 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
WDR46O15213 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
WDR46O15213 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
WDR46O15213 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR46O15213 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR46O15213 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR46O15213 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR46O15213 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR46O15213 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR46O15213 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR46O15213 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR46O15213 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR46O15213 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR46O15213 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
WDR46O15213 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR46O15213 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR46O15213 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR46O15213 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR46O15213 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR46O15213 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR46O15213 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR46O15213 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR46O15213 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WDR46O15213 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms