Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHOX2AO14813 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PHOX2AO14813 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms