Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFRSF10AO00220 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10AO00220 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10AO00220 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10AO00220 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10AO00220 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10AO00220 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10AO00220 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10AO00220 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10AO00220 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10AO00220 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10AO00220 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10AO00220 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFRSF10AO00220 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF10AO00220 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF10AO00220 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF10AO00220 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF10AO00220 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF10AO00220 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF10AO00220 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms