Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAPO00193 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAPO00193 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAPO00193 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAPO00193 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAPO00193 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAPO00193 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAPO00193 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAPO00193 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAPO00193 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAPO00193 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAPO00193 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAPO00193 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAPO00193 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAPO00193 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAPO00193 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAPO00193 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMAPO00193 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAPO00193 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAPO00193 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAPO00193 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAPO00193 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAPO00193 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAPO00193 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAPO00193 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAPO00193 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAPO00193 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAPO00193 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAPO00193 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAPO00193 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAPO00193 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAPO00193 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAPO00193 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SMAPO00193 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAPO00193 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAPO00193 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAPO00193 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAPO00193 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAPO00193 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAPO00193 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAPO00193 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAPO00193 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SMAPO00193 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMAPO00193 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAPO00193 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAPO00193 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAPO00193 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAPO00193 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAPO00193 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAPO00193 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAPO00193 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAPO00193 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAPO00193 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAPO00193 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAPO00193 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAPO00193 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SMAPO00193 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAPO00193 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAPO00193 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAPO00193 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAPO00193 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAPO00193 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAPO00193 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAPO00193 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAPO00193 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAPO00193 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAPO00193 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAPO00193 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAPO00193 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAPO00193 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMAPO00193 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAPO00193 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMAPO00193 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms