Protein–RNA interactions for Protein: F5GYI3

UBAP1L, Ubiquitin-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1LF5GYI3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBAP1LF5GYI3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBAP1LF5GYI3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms