Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMO7DNF2Z398 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMO7DNF2Z398 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms