Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRRM3A6NNA2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms