Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC85CA6NKD9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms