Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
MAP3K4Q9Y6R4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
MAP3K4Q9Y6R4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC32■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC32■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MAP3K4Q9Y6R4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms