Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AUP1Q9Y679 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AUP1Q9Y679 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms