Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHOC2Q9UQ13 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHOC2Q9UQ13 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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