Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB2Q9UBS0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB2Q9UBS0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB2Q9UBS0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB2Q9UBS0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB2Q9UBS0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB2Q9UBS0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB2Q9UBS0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB2Q9UBS0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPS6KB2Q9UBS0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KB2Q9UBS0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KB2Q9UBS0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KB2Q9UBS0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KB2Q9UBS0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KB2Q9UBS0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KB2Q9UBS0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KB2Q9UBS0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KB2Q9UBS0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPS6KB2Q9UBS0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPS6KB2Q9UBS0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms