Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAPAQ9P0L0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAPAQ9P0L0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms