Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CABP1Q9NZU7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CABP1Q9NZU7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP1Q9NZU7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms